Το Πρόγραμμα Erasmus+ για Σπουδές προβλέπει και εξασφαλίζει την πλήρη αναγνώριση της περιόδου σπουδών κατά την επιστροφή των φοιτητών/τριών από το ΄Ιδρυμα Υποδοχής. Η διαδικασία αυτή διασφαλίζεται από το γεγονός ότι η συμμετοχή οποιουδήποτε Τμήματος του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας στο Πρόγραμμα συνεπάγεται τη δέσμευσή του για την αυτόματη αναγνώριση των σπουδών που οι φοιτητές πραγματοποιούν στο εξωτερικό, όπως αυτές δηλώνονται πριν από την αναχώρησή τους στη Συμφωνία Μάθησης για Σπουδές (Learning Agreement Before the Mobility) και όπως αυτές ενδεχομένως τροποποιούνται στον πίνακα "During the Mobility". Ένα μάθημα δεν αναγνωρίζεται, μόνο σε περίπτωση που δε συμπεριλαμβάνεται στις Συμφωνίες Σπουδών, και φυσικά στην περίπτωση αποτυχίας κατά την αξιολόγηση του Ιδρύματος Υποδοχής.

Τα μαθήματα που αναγνωρίζονται έχουν αντιστοιχηθεί εκ των προτέρων στο προαναφερθέν έντυπο. Σε περίπτωση για κάποιο μάθημα δεν είναι δυνατή η αντιστοίχιση, αλλά ο/η φοιτητής/τρια επιθυμεί να το παρακολουθήσει, η αναγνώριση γίνεται ως εξής:

α) ως μάθημα επιλογής (με ανάλογη μείωση του αριθμού των υποχρεωτικών μαθημάτων επιλογής, που ο φοιτητής θα παρακολουθούσε στο Ίδρυμα Προέλευσης (δεδομένου ότι αυτό βρίσκει σύμφωνο το Τμήμα του).

β) ως επιπλέον γνώση που αποκτήθηκε κατά τη διάρκεια των σπουδών (σχετική με το γνωστικό του αντικείμενο) και αναγράφεται στο παράρτημα διπλώματος που απονέμεται με τη λήψη του πτυχίου. Αυτή η κατηγορία όμως αφορά ΜΟΝΟ τις περιπτώσεις, που η συμπλήρωση του απαιτούμενου αριθμού ECTS με μαθήματα που αντιστοιχούνται είναι αδύνατη, και δεν μπορεί να ξεπερνάει το 20% των συνολικών μονάδων.

Η αναγνώριση των πιστωτικών μονάδων, του χρόνου σπουδών και της βαθμολογίας, γίνεται από το αρμόδιο όργανο του σχετικού Ακαδ.Τμήματος  βάσει των αποδεικτικών στοιχείων βαθμολογίας που οι φοιτητές προσκομίζουν στον Ακαδημαϊκό Συντονιστή του Τμήματος τους.

Ακολούθως, η Γραμματεία του Ακαδ.Τμήματος εκδίδει πιστοποιητικό αναγνώρισης στο οποίο αναγράφεται το πρόγραμμα το οποίο ο φοιτητής ολοκλήρωσε με επιτυχία στο εξωτερικό, οι μονάδες ECTS που του πιστώθηκαν καθώς και η βαθμολογία του. Το πιστοποιητικό αυτό παραδίδεται στον φοιτητή και προωθείται στο Γραφείο Erasmus προκειμένου να κλείσει ο φάκελος της κάθε μετακίνησης.